ביום 28.7.2026 פורסם נייר עמדה 07/2026 של רשות המסים בישראל שמתייחסת לסוגית החבות במס שכר בגין שכר עובדי מלכ"ר השוהים בחו"ל במסגרת שנת שבתון.

מוסד ללא כוונת רווח (מלכ"ר) – למשל אוניברסיטה או מכון מחקר – אינו משלם מע"מ על מחזור עסקאותיו, אך חייב במס שכר על השכר שהוא משלם לעובדיו.

עובדי מלכ"ר עשויים לצאת לשבתון/מחקר בחו"ל. למשל חבר סגל אקדמי) שיוצא לשבתון אינו מקבל שכר רגיל בישראל, אלא מענקי שבתון מהמוסד בגין פעולות/פעילות בחו"ל. האם תשלומים אלה, המשולמים לאדם השוהה פיזית מעבר לים, מהווים "פעילות בישראל" החייבת במס שכר? נייר העמדה בא ליישב את הסוגיה.

מה נקבע

רשות המסים נשענת על סעיף 15(ב)(2) לחוק מע"מ, הקובע שפעילות תיחשב כמנוהלת בישראל אם ניהל אותה מי שעיקר פעילותו בישראל, והיא בתחום שהוא מנהל. מכאן שלושה תנאים מצטברים:

הפעילות בניהול המלכ"ר. כאן מוצעת רשימה פתוחה של סימני היכר: מטרת השבתון – האם היא קידום עבודתו המדעית של העובד עבור המוסד; האם היציאה טעונה אישור המוסד ולפי אילו שיקולים; האם קיימת חובת דיווח שוטף או דו"ח סיכום; האם העובד כפוף לנהלי המוסד בענייני חופשה, הכנסה נוספת, קניין רוחני וניגוד עניינים; ולמי שייכים תוצרי העבודה. נבחן גם אופן המימון – האם דמי השבתון הם זכות מוקנית או החלטה של המוסד לממן פעילות לתועלתו שלו.

עיקר פעילות המלכ"ר בישראל. כאשר הקמפוס, המעבדות ורוב העובדים והתלמידים נמצאים בארץ – התנאי מתקיים.

זהות תחומי הפעילות. אם המוסד עוסק במחקר והוראה, והעובד עוסק בחו"ל במחקר או בהוראה – מדובר באותו תחום. במלכ"ר שאינו אקדמי, הבחינה תיעשה מול תחום עיסוקו הייחודי.

בהתקיים שלושת התנאים – כל הסכומים המשולמים לעובד בשנת השבתון חייבים במס שכר, גם בעת שהותו מחוץ לישראל.

המשמעות המעשית

ההנחה המעשית היא חבות. מוסדות אקדמיים ומלכ"רים אחרים המממנים שבתונים צריכים לוודא שדמי השבתון נכללים בבסיס לחישוב מס שכר, ולבחון את החשיפה גם לשנים פתוחות. מנגד, נייר העמדה אינו יוצר חזקה חלוטה: מלכ"ר שאצלו השבתון הוא זכות עצמאית של העובד, ללא פיקוח, ללא חובת דיווח וללא זיקה לתחום פעילות המוסד – יכול לטעון שהתנאים אינם מתקיימים. לכן כדאי לעבור על תקנוני השבתון והסכמי ההעסקה ולראות אילו סממני שליטה עולה מהם.

הבהרה נוספת בסעיף 4(א) עצמו: מלגה לסטודנט או לחוקר לפי סעיף 9(29) לפקודת מס הכנסה אינה "שכר" ואינה חייבת במס שכר. הבחנה זו בין מלגה פטורה לבין דמי שבתון עשויה להיות משמעותית בסיווג התשלום.

האמור אינו יעוץ מקצועי ואינו מחליף יעוץ ספציפי ומהווה אך ורק מידע כללי. ניתן לפנות למשרדינו ליעוץ מקצועי ספציפי.